较早的数据深入研究显示,许多比较简单的本能变异,包括疟疾,都表现出连续性倾向差别的相似性。这些连续性倾向差别被不同相对地归因于内分泌、连续性碱基、等位遗传基因×连续性倾向振荡、行为差别和环境暴露的差别。然而,至今为止,它们的组态和基本生态学原理在非常大相对上始终是未知的。
等位遗传基因-民间组织传达(GTEx)新项目提供了一个从中,让我们可以通过数据深入研究许多以前都未以这种方式并不一定的民间组织,来探索本能激活组中都连续性倾向差别的普遍连续性和突变组态。
已经有,数据深入研究管理人员在Science时尚杂志刊发。为了并不一定本能激活组及其诱导的连续性倾向差别,并发现连续性倾向和突变学如何彼此之间互严重影响比较简单的等位基因和疟疾,数据深入研究管理人员在GTEx新项目(v8样本发布)调查的44个本能民间组织来源中都分解成了甲基化及其突变诱导的连续性倾向差别目录,并深入研究了16245个RNA测序样本和838个成年人生殖的等位遗传基因。
在此基础上,数据深入研究管理人员研究报告了甲基化技术水平、民间组织肝细胞特连续性组成和顺式传达量化等位基因亚基(cis-eQTLs)的连续性倾向差别。为了评估它们的严重影响,数据深入研究管理人员将这些结果与87个GWAS的等位基因功能、激活位点彼此之间辅彼此之间成原文和全等位线粒体相关联数据深入研究(GWAS)综合统计彼此之间彼此之间辅彼此之间成。
结果显示,连续性倾向对甲基化的严重影响是无处不在的 (在所有民间组织中都,数据深入研究管理人员鉴定了13 294个有连续性倾向差别的等位基因)。然而,这些严重影响很小,而且主要是民间组织甲基化的。
兼具连续性倾向差别传达的等位基因主要不是由民间组织甲基化甲基化转子的,而是作准备了一系列专业化的生物功能,如药物和雌激素反应、胚胎和民间组织形态发生、配子、连续性生殖和精子发生、脂肪代谢、癌症和免疫反应等。
而X连接等位基因在男士中都传达较高,提示了逃避X碱基失活的候选等位基因,不常碱基等位基因的连续性倾向倾向连续性传达提示了与雌激素彼此之间关的激活位点诱导和额外激活位点的起到,以及表观突变学标明的连续性倾向差别连续性分布,特别是组蛋白H3 Lys27三甲基化(H3K27me3)。
甲基化的突变诱导的连续性倾向差别要少得多(在所有民间组织中都鉴定出了369个连续性倾向倾向的eQTL),并且兼具相对的民间组织甲基化。数据深入研究管理人员发现了58个由单一连续性倾向的甲基化突变诱导转子的等位基因-等位基因相关联。这些包括连续性倾向差别的肝细胞特连续性核素介导等位遗传基因-变异相关联的亚基,以及连续性倾向可能在相关联的潜在水分子组态中都发挥更从外部起到的亚基。例如,数据深入研究管理人员在胰脏中都发现了一个男士甲基化的六还原酶HKDC1的eQTL,它严重影响怀孕男士的代谢,随后反映在后裔的出生地体重上。
因此,通过将GTEx样本的连续性倾向意识深入研究与等位基因功能和激活位点彼此之间辅彼此之间成原文彼此之间建立联系,数据深入研究管理人员详细描述了所致本能激活组和eQTLs连续性倾向差别的民间组织甲基化和民间组织构建的转子心理因素和组态。
数据深入研究管理人员发现了多个连续性倾向差别的甲基化振荡,这些振荡与比较简单的等位基因突变相关联顺式,从而促进了GWAS信号的内源连续性解释。
由于许多变异的致病民间组织是未知的,因此对专业化的GTEx民间组织获取的深入研究可以作为调查连续性倾向偏倚等位基因基础的稳固资源。这项工作对本能激活组的连续性倾向差别及其突变诱导进行了广泛的并不一定。
原始出处:
Meritxell Oliva et al. The impact of sex on gene expression across human tissues. Science (2020). DOI: 10.1126/science.aba3066
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